中国戏曲学院音乐专业的本科教学始于1984年的首届作曲班，时称作曲系，系主任为关雅浓先生。1985年，京剧器乐专业开始大专教学并成立音乐系，系主任为吴炳章先生。1987年，作曲系与音乐系合并，统称音乐系。2009年，学院成立京剧系，京剧器乐专业划入京剧系。音乐系目前设有作曲与作曲技术理论、音乐表演、音乐学三个专业，涵盖戏曲作曲、音乐制作、音乐学、民族器乐四个专业方向，其中戏曲作曲专业方向是音乐系最具有传统优势，在全国居于领先地位的特色专业方向。